MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 90347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009484	CTT	2	6	41794	41799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259064
1002	NC_009484	CG	3	6	41811	41816	0 %	0 %	50 %	50 %	148259064
1003	NC_009484	GCG	3	9	41814	41822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1004	NC_009484	GGC	2	6	41839	41844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1005	NC_009484	TCG	2	6	41849	41854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259064
1006	NC_009484	GCC	2	6	41935	41940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1007	NC_009484	CCG	2	6	41978	41983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1008	NC_009484	GAG	2	6	41999	42004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259064
1009	NC_009484	GC	3	6	42042	42047	0 %	0 %	50 %	50 %	148259064
1010	NC_009484	CAG	2	6	42079	42084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259064
1011	NC_009484	GCG	2	6	42090	42095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1012	NC_009484	CTT	2	6	42166	42171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259064
1013	NC_009484	GAA	2	6	42193	42198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259064
1014	NC_009484	ATG	2	6	42200	42205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259064
1015	NC_009484	AGC	2	6	42215	42220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259064
1016	NC_009484	CG	3	6	42223	42228	0 %	0 %	50 %	50 %	148259064
1017	NC_009484	AGCCG	2	10	42243	42252	20 %	0 %	40 %	40 %	148259064
1018	NC_009484	GTGC	2	8	42267	42274	0 %	25 %	50 %	25 %	148259064
1019	NC_009484	GTC	2	6	42458	42463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259064
1020	NC_009484	CCG	2	6	42521	42526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1021	NC_009484	CGC	2	6	42591	42596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1022	NC_009484	CGC	2	6	42673	42678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1023	NC_009484	CGTCGG	2	12	42679	42690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148259064
1024	NC_009484	GCC	2	6	42697	42702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259064
1025	NC_009484	CCT	2	6	42705	42710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259064
1026	NC_009484	CAATG	2	10	42748	42757	40 %	20 %	20 %	20 %	148259064
1027	NC_009484	GGC	2	6	42766	42771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1028	NC_009484	GCG	2	6	42784	42789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259064
1029	NC_009484	T	6	6	42800	42805	0 %	100 %	0 %	0 %	148259064
1030	NC_009484	GCC	2	6	43361	43366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1031	NC_009484	GGC	2	6	43402	43407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259065
1032	NC_009484	CAT	2	6	43420	43425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259065
1033	NC_009484	ATC	2	6	43568	43573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259065
1034	NC_009484	CT	3	6	43589	43594	0 %	50 %	0 %	50 %	148259065
1035	NC_009484	CAG	2	6	43636	43641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259065
1036	NC_009484	CGCGC	2	10	43665	43674	0 %	0 %	40 %	60 %	148259065
1037	NC_009484	CGG	2	6	43691	43696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259065
1038	NC_009484	GCC	2	6	43709	43714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1039	NC_009484	GGT	2	6	43738	43743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259065
1040	NC_009484	GCCG	2	8	43753	43760	0 %	0 %	50 %	50 %	148259065
1041	NC_009484	GCC	2	6	43807	43812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1042	NC_009484	GAT	2	6	43846	43851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259065
1043	NC_009484	TCG	2	6	43928	43933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259065
1044	NC_009484	ATC	2	6	44027	44032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259065
1045	NC_009484	CCG	2	6	44043	44048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1046	NC_009484	GCC	2	6	44051	44056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1047	NC_009484	CGC	2	6	44110	44115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
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1049	NC_009484	CGA	2	6	44133	44138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259065
1050	NC_009484	CAG	2	6	44242	44247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259065
1051	NC_009484	GCG	2	6	44270	44275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259065
1052	NC_009484	GAG	2	6	44306	44311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259065
1053	NC_009484	GCC	2	6	44329	44334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259065
1054	NC_009484	GGCGCC	2	12	44335	44346	0 %	0 %	50 %	50 %	148259065
1055	NC_009484	GC	3	6	44353	44358	0 %	0 %	50 %	50 %	148259065
1056	NC_009484	TCGA	2	8	44363	44370	25 %	25 %	25 %	25 %	148259065
1057	NC_009484	GCG	2	6	44506	44511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259065
1058	NC_009484	CGGC	2	8	44516	44523	0 %	0 %	50 %	50 %	148259065
1059	NC_009484	CAT	2	6	44753	44758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259066
1060	NC_009484	GC	3	6	44973	44978	0 %	0 %	50 %	50 %	148259066
1061	NC_009484	GGTC	2	8	45007	45014	0 %	25 %	50 %	25 %	148259066
1062	NC_009484	CG	4	8	45067	45074	0 %	0 %	50 %	50 %	148259066
1063	NC_009484	GCC	2	6	45098	45103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259066
1064	NC_009484	CG	3	6	45149	45154	0 %	0 %	50 %	50 %	148259066
1065	NC_009484	TCG	2	6	45180	45185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259066
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1067	NC_009484	GGGGA	2	10	45246	45255	20 %	0 %	80 %	0 %	148259066
1068	NC_009484	GC	3	6	45284	45289	0 %	0 %	50 %	50 %	148259066
1069	NC_009484	GC	3	6	45332	45337	0 %	0 %	50 %	50 %	148259066
1070	NC_009484	GCC	2	6	45474	45479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259066
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1072	NC_009484	TCG	2	6	45495	45500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259066
1073	NC_009484	CGA	2	6	45511	45516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259066
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1075	NC_009484	GC	4	8	45609	45616	0 %	0 %	50 %	50 %	148259066
1076	NC_009484	CGGTC	2	10	45628	45637	0 %	20 %	40 %	40 %	148259066
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1083	NC_009484	TCCAGT	2	12	46566	46577	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148259067
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1092	NC_009484	CAGTCG	2	12	46932	46943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148259068
1093	NC_009484	GGC	2	6	46986	46991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259068
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1096	NC_009484	CCG	2	6	47057	47062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259068
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1098	NC_009484	CGG	2	6	47148	47153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259068
1099	NC_009484	GCC	2	6	47210	47215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259068
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1102	NC_009484	CGC	2	6	47326	47331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259068
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1105	NC_009484	TA	3	6	47493	47498	50 %	50 %	0 %	0 %	148259069
1106	NC_009484	CGG	2	6	47526	47531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259069
1107	NC_009484	GCG	2	6	47541	47546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259069
1108	NC_009484	CG	3	6	47587	47592	0 %	0 %	50 %	50 %	148259069
1109	NC_009484	GCG	2	6	47602	47607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259069
1110	NC_009484	GCCGG	2	10	47636	47645	0 %	0 %	60 %	40 %	148259069
1111	NC_009484	CAA	2	6	47647	47652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259069
1112	NC_009484	CGCGG	2	10	47671	47680	0 %	0 %	60 %	40 %	148259069
1113	NC_009484	CGC	2	6	47715	47720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259069
1114	NC_009484	CGC	3	9	47724	47732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259069
1115	NC_009484	GCGA	2	8	47738	47745	25 %	0 %	50 %	25 %	148259069
1116	NC_009484	GCC	2	6	47747	47752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259069
1117	NC_009484	GCG	4	12	47753	47764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259069
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1120	NC_009484	CG	4	8	47851	47858	0 %	0 %	50 %	50 %	148259069
1121	NC_009484	GCT	2	6	47881	47886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259069
1122	NC_009484	CGGCG	3	15	47887	47901	0 %	0 %	60 %	40 %	148259069
1123	NC_009484	CGAT	2	8	47910	47917	25 %	25 %	25 %	25 %	148259069
1124	NC_009484	GCG	2	6	47925	47930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259069
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1126	NC_009484	CCGG	2	8	48024	48031	0 %	0 %	50 %	50 %	148259069
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